docs: journal集約・整理 (Week 006-008) および README修正

docs: 仕様書のリフレッシュ（sqlite-vecへの統一、実装整合の反映）と関連ファイルの整理

サイドカー自動起動・監視、llama_server状態API、UI連携、ESLint/Prettier整備、journal追加